Η Εγνατία Οδός για την κατασκευή και την ολοκλήρωση της έχει διασφαλισμένους πόρους και χρηματοδοτείται από:

• Το Ελληνικό Δημόσιο (Εθνικοί πόροι)
• Την Ευρωπαϊκή Ένωση (με ποσοστό 50%): Ταμείο Συνοχής, Ευρωπαϊκό Ταμείο Περιφερειακής Ανάπτυξης, Διευρωπαϊκά Δίκτυα Μεταφορών
• Την Ευρωπαϊκή Τράπεζα Επενδύσεων
• Το Κοινοτικό Πλαίσιο Στήριξης